在日本菜中，蔥不總是配角，也可以當作主菜來吃，甚至可以擺“全蔥宴”，“蔥料理”以京都和大阪的最為著名。
九州的博多地區產的蔥因為鮮嫩美味，可以被單獨加工成多種菜肴而被稱為“萬能蔥”，據說有70多種做法。
大蔥富含一種被稱為有機硫化物的硫化丙烯，可使體內祛除致癌物的酵素活性增強，阻止癌變。蔥葉中含有的多醣體可與癌細胞凝集，從而抑制癌細胞生長。吃蔥被看作是日本人癌癥發病率低的原因之一。
日本人開發出不少 “以蔥做藥”的小偏方。比如，日本人喜歡用糯米和蔥白一起熬湯喝，認為它比姜湯還能驅寒，可以預防感冒、消除疲勞。
除此之外，大蔥泡酒在日本人的生活中很常見。
具體做法是先把大蔥切小段，放入低度酒中，蓋緊蓋子放兩周，當顏色為淡綠色后就可以了。睡覺之前喝一小杯這種酒，不僅有助于睡眠，甚至還可以壯陽。蔥還被認為是一種“聰明藥”，因為它可以促進血液循環、刺激神經，加快人的反應。
因而也有人開發出以蔥為主要成分的蔬菜復合片，稱其可以“提高智力”。
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