嚴格地監視著細胞周期事件的發生、發展過程是否嚴格按程序進行控制點稱為關卡。如酵母細胞在DNA合成開始前的啟動點(start)、哺乳類細胞周期的G1期R點或限制點(restriction point)等。這些關卡保證了細胞周期的正常進行，如DNA損傷未修復前不能進入S期, S期DNA合成未完成不能進入M期, 如果M期的紡錘體和染色體連接不良則不能進入后期。在典型的細胞周期控制系統中至少有三個關卡: G1關卡(靠近G1末期)、G2關卡(在G1期結束點)、中期關卡(在中期末)。在每一個關卡,由細胞所處的狀態和環境決定細胞能否通過此關卡,進入下一個階段。