組蛋白是真核生物染色體的基本結構蛋白, 是一類小分子堿性蛋白質, 有五種類型：H1 、H2A 、H2B 、H3 、H4，它們富含帶正電荷的堿性氨基酸, 能夠同DNA中帶負電荷的磷酸基團相互作用。
組蛋白的基因非常保守。親緣關系較遠的種屬中, 四種組蛋白(H2A、H2A、H3、H4)氨基酸序列都非常相似, 如海膽組織H3的氨基酸序列與來自小牛胸腺的H3的氨基酸序列間只有一個氨基酸的差異, 小牛胸腺的H3的氨基酸序列與豌豆的H3也只有4個氨基酸不同。不同生物的H1序列變化較大, 在某些組織中,H1被特殊的組蛋白所取代。如成熟的魚類和鳥類的紅細胞中H1 則被H5 所取代, 精細胞中則由精蛋白代替組蛋白。染色質中的組蛋白與DNA的含量之比為1:1。
