一般地說，基因占有哪個位置，其遺傳效應不變。但少數也有因為基因所處的位置不同而改變其表型的，此稱為位置效應（A．H．Sturtevant，1925）。位置效應有兩類，一是穩定型（S）；一是變動型（V）（E．B．Lewis，1950）。所謂S型效應，是指2個突變基因排列為順式（ab/ ）和反式（a / b）時表型不同。例如關于黃果蠅的星狀眼（star）和星體眼（asteroit），順式時（Sast/ ）黃果蠅復眼大小近于正常（稍�。�，與之相反，反式時（S / ast）眼睛便顯著變小。關于V型位置效應，已知當正�；蛭挥诋惾旧|附近時，有些細胞表現為正常性狀，另有些細胞表現為突變性狀。例如黃果蠅X染色體的w 基因經過倒位占有靠近核仁形成區異染色質的位置時，其復眼表現為嵌合性，既有正常的小眼，也有白眼小眼。如果該基因再倒位，回復到原有位置時，則復眼表現為穩定的正常表現型。因此可知，其基因本身并沒有發生改變。
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