《食品生產許可證》年度審查主要企業生產條件是否有重大變化，是否有重大質量投訴，是否存在較為嚴重的質量安全問題，實行自檢的企業是否按規定送樣到檢驗機構檢驗；實行委托出廠檢驗的生產企業是否按委托檢驗協議進行了委托出廠檢驗；對出廠檢驗不合格的產品是否按規定不予出廠銷售等。實施年度審查可以對企業產品進行實施抽樣檢驗。定期監督檢查兩次都合格的企業，年度審查時一般不進行抽樣檢驗。