一、遍灑法 此法能徹底殺滅病原體，可用于治療，也可用于預防。方法是將配制好的藥液遍灑全魚池，讓魚池水達到一定的濃度，以殺滅魚池中及魚體表外的病原體。缺點是用藥量大，池水體積的計算麻煩，副作用比較大。藥物的安全范圍較小時，要謹慎使用，以免造成危害。

二、掛簍或掛袋法 此法副作用小、危險系數低（幾乎沒有危險）、用藥量小、簡便易行。方法是將盛有藥物的簍或袋懸掛在魚池食場周圍，形成一定范圍的消毒區，以殺滅攝食魚魚體表面的病原體。但必須掌握好用藥量，使消毒區內池水的最高忍耐濃度保持在藥物安全范圍內，且能使池水濃度保持2至3小時，做到既能治病，又不給魚造成傷害。

三、浸洗法 此法一般作為運輸前后及魚轉池預防消毒，用藥時不影響水中浮游生物，用藥量少，沒有危險性。方法是將魚集中在有較高濃度藥液的較小容器中，強迫進行短期藥浴，以殺滅魚體外表的病原體。缺點是不能殺滅水體中的病原體，需專門拉網時易損傷魚體，又麻煩。

四、口服法 此法適用于魚病的預防和治療，缺點是病魚已停止攝食或很少攝食，病情較嚴重時無效。方法是將病魚喜歡吃的餌料，連同一定量的藥物或疫苗，加上一點無毒的粘合劑一起拌勻，制成藥餌投喂，以殺滅魚體內的病原體。

五、注射法 注射法同口服法比較，具有療效好、吸收快、進入魚體的藥量準確的優點。常用的注射法有腹腔注射和肌肉注射。缺點是比較麻煩，費工費時，一般只在人工注射疫苗及給魚治療時使用。

六、涂抹法 此法只在注射催產劑及親魚檢查時使用，有副作用小、使用安全、方便，用藥量小的優點。方法是用較濃的藥液涂抹魚體表面患病的地方，以殺滅魚體的病原體。涂抹時應注意將魚頭持向上方，防止藥液流人魚鰓造成危害。