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常見的有室內貯藏、井窖貯藏、棚窖貯藏、屋窖貯藏 。貯藏窯的建設應根據各地氣候和土質條件進行建設。在南方可以建地上或半地上窯，北方則應建地下窯。
1．室內貯藏 可選擇嚴密而溫暖的屋子，搭一爐子用于加溫，為方便貯藏應在圍一個囤子，長度根據屋子大小和貯藏量的多少而定。天氣寒冷時，上邊再蓋一層草簾防寒，并適當生火加溫。
2．井窖貯藏 選擇地勢高、土質堅實、地下水位低的地方，向下挖一井筒，一般直徑1米左右，井筒深5～6米。貯藏室的大小可根據貯藏量多少而定。貯藏室內要墊10～15厘米厚的干沙，其上放置甘薯。甘薯只能裝七成滿，以便留出換氣的地方，否則會因濕、熱而加重腐爛。
3．棚窖貯藏 一般挖寬約2米，長3～4米，深2米左右的地窖。將甘薯由底向上逐塊堆積，應避免甘薯與窖壁直接接觸。
4．屋窖貯藏 屋窖的結構與普遍房屋相似，但墻壁屋頂很厚，四周密封，窗戶打開，有加溫用的火道，可進行高溫愈傷處理。屋窖有大屋窖(貯1萬～5萬千克)和小屋窖兩種。小屋窖的窖體小，省工省料，適合農戶貯藏用，一般每窖可貯1 500～3 000千克。
貯藏的主要任務是調節溫度、濕度和空氣。紅薯的整個貯藏過程又分三個階段:第一階段是入窖初期,時間就是入窖后的20天,外界溫度高。這個階段的主要任務是通氣散熱,打開通風設備,使窖溫控制在13℃,濕度85～90%。第二階段是入窖20天后到來年的2月上旬,正值嚴冬季節,溫度低,保證窖溫不低于10℃。第三階段是貯藏后期。主要任務是穩定窖溫,加強通氣,外界氣溫變化很大,既要防熱又要防冷,窖溫要控制在12～14℃。貯藏量大的窖還要注意通氣散熱。
選購，保存和食用的方法
高質量的紅薯應該是外表干凈、光滑、形狀好、堅硬和發亮的。
剛收獲的紅薯經過愈傷處理，可更好地保存。愈傷處理是把紅薯保持在溫度約為30°C和相對濕度約為85％的設備中，這些條件能促進紅薯小傷口的愈合。即便小心進行愈傷處理，儲藏7個月以后，紅薯的損壞幅度也會從20％左右上升至80％左右，因此我們不宜一次購買大量的紅薯，以免變質。
小時候去農村看到人家的紅薯都是放在沙子上啊,靠土炕的根上,人家說是為了保存水分,對了,很多農業專家說紅薯喜溫，存放在11--15°C溫度環境中為佳.
要注意戒土豆,因為紅薯土豆不能存放在一起.否則,不是紅薯僵心,便是土豆長芽.
甘薯從塊根為收獲作物,鮮薯體積大,含水量高,組織幼嫩,皮薄易破損,易受冷害和感染病害而發生腐爛。甘薯在貯藏期間仍有旺盛的呼吸,呼吸強度比谷類種子大十幾倍到幾十倍、甘薯在氧充足時進行有氧呼吸,吸入氧較多,放出的二氧化碳和熱量也多。當氧不足時,甘薯進行無氧呼吸,產生酒精、二氧化碳和少量熱量。酒精對薯塊有害作用,易引起爛窖。安全貯藏對環境的要求是:最適溫度為10―14℃,濕度為80―95%,空氣中氧和二氧化碳分別為15%和5%。甘薯收獲時要輕挖、輕運、輕放。剔除帶病的、蟲咬的、破損的、水淹的薯塊,在甘薯貯藏地晾曬3―4天后入窖。貯藏方式一般采用棚窖:在戶外挖窖,深2米,寬1.5米,長度隨貯量而定。窖頂每隔80厘米放木柱1根,鋪20厘米厚的玉米秸、稻草或麥秸。上覆土0.5米左右,南邊留出口。貯藏過程中前期應注意通氣降溫,中期保溫防寒,后期應保持平穩窖溫。具體要求如下:
(一)貯藏初期:甘薯在入窖后20天內,溫度高,濕度大,常發生“發汗”現象,使堆表薯塊造成濕害,可在薯堆上覆蓋一層干草。另注意不要過早封窖口。
(二)貯藏中期:甘薯入窖后20天到第2年2月初為中期,此時氣溫低,易受冷害,要封閉窖口。薯堆上蓋草也能防止冷害。
(三)貯藏后期:甘薯經長期貯藏后生理機能衰退,此時氣溫回升,應及時打開窖口通風換氣,降低窖內溫濕度。
(四)在貯期整個期間要注意兩點,一是勤檢查,發現爛薯及時剔除;二是下窖前一定要用燈試驗,如火不滅,才能進窖